В ноябре 1999 года выходит их четвёртый альбом "Issues",который по мнению критиков,стал меньше подвержен влиянию хип-хопа и стал больше относиться к альтернативному металу.Обложку альбома разработал фанат группы,победивший на проводившемся на MTV конкурсе на лучший проект обложки.И снова первое место в 200-ке.Одновременно с выходом альбома Корн организовывает концерт с альбомной программой перед живой публикой в театре Apollo в Нью-Йорке и становится первой рок-группой,выступившей там.В своих клиппах на синглы этого альбома Корн используют компьютерные спецэффекты.В 2000 году Джонатан Дэвис обратился к к швейцарскому художнику-сюрреалисту Гигеру за помощью в создании особенной стойки для микрофона.Биомеханическая стойка была продемонстрирована в 2002 году во время турне,посвященном их пятому альбому.